DNA απολιθωμένων πουλιών ηλικίας 19.000 ετών

Ένα βήμα πιο κοντά στην ανακατασκευή του γονιδιώματος εξαφανισμένων ειδών βρίσκονται πλέον Αυστραλοί επιστήμονες, οι οποίοι, για πρώτη φορά στον κόσμο, κατάφεραν να αποσπάσουν και να απομονώσουν DNA από τα απολιθωμένα τσόφλια αυγού εξαφανισμένων σήμερα πουλιών, όπως το γιγάντιο μόα και το πουλί-ελέφαντας, που έζησαν πριν από πολλές χιλιάδες χρόνια. 

 

Το γιγάντιο πουλί Μόα

Το επίτευγμα αυτό αποτελεί σημαντική πρόοδο στην προσπάθεια να ανακατασκευαστεί το γονιδίωμα εξαφανισμένων ειδών, αν και οι επιστήμονες προειδοποιούν ότι πως κάτι τέτοιο δεν σημαίνει κατ' ανάγκην ότι είναι δυνατό -ή επιθυμητό- να "ξαναζωντανέψει" στην εποχή μας ένα προ πολλού χαμένο ζώο, όπως είχε συμβεί στο βιβλίο του Μάικλ Κράιτον και στην ομώνυμη ταινία του Στίβεν Σπίλμπεργκ.

Η απομόνωση του μιτοχονδριακού DNA έγινε από ερευνητές του πανεπιστημίου Μέρντοχ του Περθ, υπό τον Μάικλ Μπουνς, και δημοσιεύτηκε στο περιοδικό "Proceedings of Royal Society B" της Βασιλικής Εταιρίας επιστημών της Βρετανίας, σύμφωνα με το Γαλλικό Πρακτορείο.

Οι ερευνητές απέσπασαν το γενετικό υλικό από αποξηραμένες μεμβράνες στο εσωτερικό των αυγών, που είχαν βρεθεί σε 13 τοποθεσίες στην Αυστραλία και τη Νέα Ζηλανδία. Πήραν, με τον τρόπο αυτό, αρχαίο DNA του γιγάντιου μόα (Dinornis), ενός "ξαδέλφου" της στρουθοκαμήλου, που δεν πετούσε κι έφτανε τα τέσσαρα μέτρα σε ύψος. Το πουλί αυτό είχε οδηγηθεί σε εξαφάνιση από τους κυνηγούς Μαορί της Ν.Ζηλανδίας μέχρι το τέλος του 18ου αιώνα.

Επίσης απομονώθηκε γενετικό υλικό από το πουλί-ελέφαντα (Aepyornis), που έφτανε τα τρία μέτρα σε ύψος και εξαφανίστηκε κατά τον ευρωπαϊκό αποικισμό της Μαδαγασκάρης ως το 1700. Το αυγό αυτού του πουλιού είναι 160 φορές μεγαλύτερο από το αυγό μιας κότας και αποτελεί το μεγαλύτερο αυγό πουλιού που έχει ποτέ βρεθεί.

Ακόμα, ελήφθη DNA από μια αρχαία αυστραλιανή κουκουβάγια, μια νεοζηλανδική πάπια αγνώστου χρονολογίας, καθώς και από ένα έμου (Dromaius novaehollandiae), που έζησε πριν 19.000 χρόνια περίπου και ήταν το παλαιότερο απολίθωμα από όλα.

Οι ερευνητές, προς το παρόν τουλάχιστον, δεν μπόρεσαν να απομονώσουν DNA από παλαιότερα δείγματα, ηλικίας έως και 50.000 ετών, όπως από το πουλί Genyornis. Η νέα τεχνική απομόνωσης του DNA περιλαμβάνει τον θρυμματισμό του απολιθωμένου κελύφους του αυγού σε σκόνη, την εξαγωγή του γενετικού υλικού με χημικές μεθόδους στο εργαστήριο και μετά την ενίσχυσή του με πολυμεράση.

Οι ερευνητές δήλωσαν ότι μπόρεσαν να "διαβάσουν" ένα πολύ μικρό τμήμα του συνολικού DNA, λιγότερο από το 1% του συνολικού γονιδιώματος του πουλιού, κατάφεραν όμως να αποδείξουν ότι είναι εφικτή η απομόνωση αρχαίου DNA από απολιθώματα. Σε επόμενο στάδιο, θα επιχειρήσουν να αποκωδικοποιήσουν μεγάλα πλέον τμήματα του DNA, ώστε να ανοίξουν στους παλαιοντολόγους ένα νέο "παράθυρο" στα πλάσματα του απώτερου παρελθόντος.

Μέχρι σήμερα, αρχαίο DNA είχε απομονωθεί από οστά (π.χ. του Νεάντερταλ) και από τρίχες. Τα τσόφλια των αυγών είχαν αγνοηθεί, αλλά τώρα πια επανεκτιμώνται ως μια εν δυνάμει πολύτιμη πηγή γενετικού υλικού, καθώς, μεταξύ άλλων, ανθίστανται περισσότερο από τα οστά στη διείσδυση βακτηρίων και συνεπώς στην μετέπειτα "μόλυνση" του πρωτογενούς DNA.

Επιπλέον, τα υπολείμματα αυγών υπάρχουν σε αφθονία σε διάφορα μέρη της Γης.

Αν το περιβάλλον υπήρξε αρκετά κρύο, σύμφωνα με τους ερευνητές, τότε είναι δυνατό να απομονωθεί DNA από απολιθωμένα αυγά πολύ παλαιότερα των 19.000 ετών, όχι όμως από αυγά που, μετά από εκατοντάδες χιλιάδες χρόνια, έχουν πλήρως "ορυκτοποιηθεί", έχουν δηλαδή γίνει σαν πέτρες.

enet.gr

earth : Οργανικές ουσίες είχε αρχαίος μετεωρίτης που έπεσε στην Γη

Οργανικές ουσίες ανακάλυψαν Γερμανοί επιστήμονες σε διαστημικό βράχο που έπεσε στον πλανήτη μας πριν από περίπου 40 χρόνια και ο οποίος είναι πιθανότατα παλαιότερος ακόμα και από τον ήλιο. Πρόκειται για τον μετεωρίτη του «Μέρτσισον» που βρέθηκε το 1969 σε μια πόλη της Αυστραλίας με αυτό το όνομα και είναι η πρώτη μελέτη που ανέλυσε το σύνολο των ουσιών του βράχου.

Η ενδελεχής μελέτη του βράχου έγινε από ερευνητές με επικεφαλής τον δρ Φίλιπ Σμιτ-Κόπλιν του γερμανικού Ινστιτούτου Οικολογικής Χημείας και δημοσιεύτηκε στο περιοδικό PNAS της Εθνικής Ακαδημίας Επιστημών των ΗΠΑ, σύμφωνα με το BBC. Ο μετεωρίτης αναμένεται να επιτρέψει στους επιστήμονες να ρίξουν φως στις συνθήκες που επικρατούσαν κατά την εποχή που γεννήθηκε το ηλιακό μας σύστημα.

Η μελέτη του μετεωρίτη και η ανακάλυψη των οργανικών ουσιών δείχνει ότι πιθανότατα το αρχέγονο ηλιακό μας σύστημα είχε μεγαλύτερη μοριακή ποικιλία από τη σημερινή Γη.

Ο συγκεκριμένος μετεωρίτης έχει εξεταστεί ξανά στο παρελθόν, αλλά για την εύρεση συγκεκριμένων ουσιών. Είναι η πρώτη μελέτη που ανέλυσε το σύνολο των ουσιών και επιβεβαίωσε την ύπαρξη μιας τεράστιας ποικιλίας χημικών ουσιών που βασίζονται στον άνθρακα, δηλαδή οργανικών. Μεταξύ άλλων, με τη βοήθεια νέων εργαλείων υψηλής ανάλυσης και φασματοσκοπίων, εντοπίστηκαν 70 αμινοξέα, τα οποία θεωρούνται ο θεμέλιος λίθος της ζωής, καθώς από αυτά δημιουργήθηκε το DNA.

Οι επιστήμονες δεν αποκλείουν ότι, με ακόμα πιο βελτιωμένες τεχνικές ανάλυσης, θα μπορέσουν να ανιχνεύσουν ακόμα περισσότερες ουσίες στο βράχο, ο οποίος πιθανότατα έχει ηλικία μεγαλύτερη των 4,65 δισ. ετών του ήλιου μας.

tvxs.gr

Βιοανιχνευτές εντοπίζουν τους καρκινικούς όγκους από το DNA τους

Πολλά υποσχόμενη τεχνική

Η νέα αυτή τεχνική σηματοδοτεί μια πρόοδο στις εξατομικευμένες αντικαρκινικές θεραπείες

Σαν Ντιέγκο: Αμερικανοί ερευνητές δημιούργησαν βιοανιχνευτές που εντοπίζουν διάφορες μορφές καρκίνου από το DNA των όγκων, εξέλιξη που επιτρέπει την αποτελεσματικότερη αντιμετώπισή τους, σύμφωνα με τα αποτελέσματα έρευνας που παρουσιάστηκε στις ΗΠΑ.
Η νέα αυτή τεχνική για τον εντοπισμό των καρκινικών κυττάρων από τα γενετικά χαρακτηριστικά του κάθε όγκου, σηματοδοτεί μια πρόοδο στις εξατομικευμένες και με προσδιορισμένο στόχο αντικαρκινικές θεραπείες.
«Σήμερα δεν υπάρχει κανένα τεστ που να στηρίζεται σε βιοανιχνευτές για την κλινική θεραπεία του καρκίνου και πιστεύουμε ότι αυτή η τεχνική αποτελεί ένα σημαντικό βήμα στην εφαρμογή των τεχνολογιών αποκωδικοποίησης του ανθρώπινου γονιδιώματος για την εξατομίκευση των αντικαρκινικών θεραπειών», εξηγεί ο Δρ Βίκτορ Βελκουλέσκου, καθηγητής ογκολογίας στη σχολή ιατρικής του Πανεπιστημίου Τζον Χόπκινς στο Μέριλαντ των ΗΠΑ.
Τα αποτελέσματα της έρευνας αυτής θα δημοσιευτούν στην επιθεώρηση Science Translational Medicine που θα κυκλοφορήσει στις 24 Φεβρουαρίου.
Η έρευνα αυτή αποτέλεσε επίσης σήμερα το αντικείμενο παρουσίασης στην ετήσια διάσκεψη της Αμερικανικής Ένωσης για την Πρόοδο της Επιστήμης (AAAS), η οποία πραγματοποιείται από τις 18 ως τις 22 Φεβρουαρίου στο Σαν Ντιέγκο της Καλιφόρνιας.
Το νέο τεστ θα επιτρέπει να εντοπίζεται και να παρακολουθείται η εξέλιξη των καρκινικών κυττάρων ή των καρκινικών όγκων έτσι ώστε οι επιστήμονες να διαγιγνώσκουν αν η θεραπεία που ακολουθείται είναι αποτελεσματική.
Η τεχνική αυτή εντοπίζει με πιο ακριβή τρόπο τη γενετική «υπογραφή» των καρκινικών όγκων ή των υπολειμμάτων τους έπειτα από μια χειρουργική επέμβαση ή κατά τη διάρκεια των χημειοθεραπειών.
Αυτό που ήταν πολύ δύσκολο μέχρι σήμερα, ήταν να εντοπιστούν και να χαρτογραφηθούν με ακρίβεια οι γενετικές τροποποιήσεις των καρκινικών όγκων.
Έπειτα από έρευνες που έκανε πάνω σε έξι κρούσματα καρκίνου, τέσσερα του εντέρου και δύο του μαστού, η ομάδα του Δρ Βελκουλέσκου μπόρεσε να δημιουργήσει βιοανιχνευτές βάσει των ξεχωριστών γενετικών αλληλουχιών του κάθε όγκου.
Κατ'αυτόν τον τρόπο μια απλή ανάλυση αίματος επιτρέπει να ξεχωρίσουν οι επιστήμονες και το παραμικρό ίχνος DNA ενός καρκινικού όγκου σε μεγάλες ποσότητες αίματος ή άλλων υγρών των οποίων το DNA είναι φυσιολογικό.

pathfinder.gr

DNA : Θα μπορούσαν να ξαναζήσουν οι Νεάντερνταλ;

Οι ερευνητές βρίσκονται πιο κοντά από ποτέ στο πρώτο σχέδιο μίας πλήρους αλληλουχίας του γονιδιώματος μίας γυναίκας Νεάντερνταλ, που έζησε πριν από 30.000 χρόνια, πράγμα που σημαίνει πως ίσως μία μέρα να είναι δυνατή η δημιουργία ενός ζωντανού ανθρώπου από αυτή την αλληλουχία του DNA.

Η γυναίκα Νεάντερνταλ πέθανε στη σπηλιά Vindija, που βρίσκεται στην Κροατία. Οι Νεάντερνταλ είναι οι πιο κοντινοί εξαφανισμένοι συγγενείς των σύγχρονων ανθρώπων. Ο Homo sapiens και οι Νεάντερνταλ συνυπήρξαν για 5.000-7.000 χρόνια, αλλά οι Νεάντερνταλ αναγκάστηκαν σταδιακά να μετακινηθούν προς τα εδάφη που βρίσκεται σήμερα η Ευρώπη.Τα κομμάτια DNA από τα οστά της γυναίκας συναρμολογήθηκαν με τη βοήθεια γονιδιωμάτων, που πήραν οι επιστήμονες από ανθρώπους και χιμπατζήδες. Ο ερευνητής Gerald Irzyk δήλωσε πως η τοποθέτηση των κομματιών στη σειρά είναι πολύ δύσκολη γιατί αρχικά φαίνεται ως μία τυχαία συναρμολόγηση των βάσεων νουκλεοτιδίων, αλλά υπάρχουν μοντέλα και σχηματισμοί που είναι συγκεκριμένα για κάποιες ομάδες οργανισμών.
Το εγχείρημα για τη χαρτογράφηση του γονιδιώματος ξεκίνησε το 2005 και πραγματοποιείται σε συνεργασία με επιστήμονες από το γερμανικό Ινστιτούτο Max Planck της Λειψίας και την εταιρεία 454 Life Sciences, που εδρεύει στο Μπράνφορντ του Κονέκτικατ. Εάν δεν υπήρχαν οι σύγχρονοι δυνατοί υπολογιστές, που επιτρέπουν στους επιστήμονες να μειώσουν δραστικά τον χρόνο και το κόστος, το έργο δεν θα ήταν δυνατό να πραγματοποιηθεί. Παρόλα αυτά, υπάρχουν ακόμα κάποια προβλήματα που καλούνται να αντιμετωπίσουν, όπως η μόλυνση, η εξασθένιση και οι χημικές αλλαγές στο βιολογικό υλικό λόγω του χρόνου.
Όταν ένας οργανισμός πεθαίνει, τα ένζυμα σπάνε το DNA σε μικρά κομμάτια μόλις λίγων εκατοντάδων ζευγών βάσης. Και το DNA, όμως, αλλάζει χημικά με τον χρόνο και μπορεί να οδηγήσει σε λανθασμένη ερμηνεία της αλληλουχίας. Και όχι μόνο αυτό αλλά πάνω από το 90% του DNA των δειγμάτων προήλθε από βακτήρια ή άλλους επιμολυντές και όχι από τα οστά.
Η δημιουργία τμημάτων του σώματος, οργάνων, ακόμα και ενός ολοκληρωμένου ζωντανού οργανισμού, μόλις ολοκληρωθεί η αλληλουχία του γονιδιώματος, θα είναι δύσκολη υπόθεση αλλά θεωρητικά είναι δυνατή. Η διαδικασία θα περιλαμβάνει πιθανόν εκατομμύρια αλλαγές στο DNA, μέσα σε ένα ανθρώπινο βλαστοκύτταρο, ώστε να ταιριάζει με τη γενετική αλληλουχία του Νεάντερνταλ. Εντούτοις, υπάρχουν κάποια προβλήματα γιατί, ακόμα και αν τα γονίδια του Νεάντερνταλ αναδημιουργηθούν, δεν γνωρίζουμε πως εκφράζονταν. Εάν υποθέσουμε ότι δημιουργούνται, το βλαστοκύτταρο μαζί με το DNA του Νεάντερνταλ θα διαχωριστούν για να παραχθεί μία αποικία κυττάρων, που στη συνέχεια θα καθοδηγηθεί για να μεταμορφωθεί σε οποιοδήποτε είδος κυττάρου του σώματος, θεωρητικά και ολόκληρου του οργανισμού.

Ο επιστημονικός διευθυντής της Advanced Cell Technology, Robert Lanza, δήλωσε στο περιοδικό Archaeology πως «κάποια είδη, όπως οι αγελάδες και οι κατσίκες, κλωνοποιούνται συνέχεια, με ελάχιστα προβλήματα,» και παρόλο που υπάρχουν πολλές περισσότερες προκλήσεις σε ότι αφορά στην κλωνοποίηση του Νεάντερνταλ, είναι πολύ πιθανό να πραγματοποιηθεί. Τα ηθικά ζητήματα που γεννιούνται από μία τέτοια πράξη σίγουρα θα προκαλέσουν πολλές διαμάχες και όχι μόνο στους κύκλους των παλαιοανθρωπολόγων.Ο συγγραφέας του άρθρου του Archaeology, Zach Zorich, που παρακολουθεί στενά την έρευνα του γονιδιώματος του Νεάντερνταλ, σημείωσε πως εάν τελικά οι επιστήμονες τα καταφέρουν, ο Νεάντερνταλ θα δικαιούται νομίμως τα ίδια ανθρώπινα δικαιώματα με εμάς.
Ενδεχομένως να περάσει αρκετός καιρός μέχρι να κληθούμε να αντιμετωπίσουμε τα ηθικά ζητήματα που θα προκύψουν. Ο Stephan Schuster, γενετιστής στο Πανεπιστήμιο της Πενσιλβάνια, εξήγησε πως το πρώτο σχέδιο του γονιδιώματος ίσως να έχει πολλά λάθη, εξαιτίας της ηλικίας του δείγματος και της μόλυνσης, ενώ υπολογίζει πως θα πρέπει να υπάρξει αλληλουχία του DNA σε πέντε διαφορετικά δείγματα των οστών, και συνολικά θα πρέπει να υπάρξει 30 φορές αλληλουχία στο γονιδίωμα ώστε να μπορούμε να είμαστε σίγουροι για την ακρίβειά του.
Η χαρτογράφηση του γονιδιώματος θα επιτρέψει στους επιστήμονες να απαντήσουν ερωτήματα για τη σχέση των Νεάντερνταλ με τον σύγχρονο άνθρωπο, όπως για παράδειγμα εάν προήλθαμε από ενδογαμική αναπαραγωγή και εάν είμαστε δύο διαφορετικά είδη. Τέλος, η χαρτογράφηση θα φανεί χρήσιμη και στην ιατρική έρευνα.

Physorg   

http://news.pathfinder.gr

Συλλέκτη οστών αναζητούν οι καραμπινιέροι

 

Το αποτρόπαιο θέαμα ανακάλυψαν πυροσβέστες τον Ιούλιο του 2007 οι οποίοι είχαν κληθεί σε περιοχή της Ρώμης, εξαιτίας πυρκαγιάς στα απόβλητα.  Η αστυνομία που έσπευσε στη περιοχή  ήρθε αντιμέτωπη με έναν ανθρώπινο σκελετό και δίπλα του βρέθηκαν πεταμένα πορτοφόλι και κλειδιά.

Οι πρώτοι ισχυρισμοί έλεγαν πως η σορός ανήκε σε έναν 77χρονο συνταξιούχο ο οποίος είχε εξαφανιστεί το Νοέμβριο του 2003. Η αστυνομία θεώρησε πως ο άτυχος συνταξιούχος έπεσε θύμα ληστείας και οι δράστες τον πυρπόλησαν. Ωστόσο, η υπόθεση πήρε παράξενη τροπή όταν οι συγγενείς του ισχυρίστηκαν πως τα ρούχα που βρέθηκαν στο σημείο του εγκλήματος δεν ήταν δικά του.

Μετά από διεξοδική εξέταση των παθολόγων της πόλης, διαπιστώθηκε ότι τα οστά δεν ήταν εν τέλει του αγνοουμένου συνταξιούχου, ενώ μια περαιτέρω εξέταση DNA έδειξε πως το κρανίο ανήκε σε μια γυναίκα της οποίας το DNA σχετιζόταν με του συνταξιούχου.

Η άτυχη γυναίκα είχε τραύματα στο κεφάλι, αλλά εξαιτίας της άσχημης κατάστασης του κρανίου δεν καθίστατο δυνατό να αποφανθούν για το εάν προκλήθηκαν από πάλη, φωτιά ή από περιπλανώμενο ζώο που βρήκε τη σωρό.

Εγκληματολόγοι διαπίστωσαν ότι ο σκελετός περιλαμβάνει οστά από 5 άτομα- 3 γυναίκες και 2 άνδρες, ηλικίας 25-55 ετών, τα οποία πέθαναν μέσα στην εικοσαετία. 

"Το κρανίο είναι το μόνο εύρημα που έχει εμφανή τραύματα αλλά δεν μπορούμε ωστόσο να δούμε πως προκλήθηκαν", δήλωσε ο Vittorio Rizzi, αστυνομικός στο τμήμα ανθρωποκτονιών της Ρώμης, συμπληρώνοντας ότι "τα υπόλοιπα οστά δεν εμφανίζουν τραύματα, ωστόσο  δεν έχουμε όλες τις σωρούς για να γνωρίζουμε τι τους συνέβη, αφού ο σκελετός που βρέθηκε είναι συνδυασμός 5 διαφορετικών ανθρώπων".

Τέλος, ανέφερε πως είναι πιθανό η υπόθεση να επρόκειτο για κάποιον αρρωστημένο συλλέκτη οστών, ο οποίος αφού σκότωσε τα 5 άτομα να δημιούργησε αυτό το "πάζλ" αλλά όπως δήλωσε, "ακόμα δεν είμαστε σε θέση να πούμε το οτιδήποτε". 

www.sport24.gr